若尔盖属高原寒带湿润季风气候。根据地貌特征，分为东部大陆性山地中温带半湿润季风气候和西部大陆性季风高原气候两种气候区。西部丘状高原，气候严寒，四季不明，冬长无夏，最冷月(1月)多年平均气温-10．6℃，绝对最低气温-33．7℃。最热月(7月)平均气温10.8℃，绝对最高气温24．6℃，年平均气温0．7℃。无绝对无霜期。多年平均降雨量656．8毫米，其中，86％多集中降于4月下旬至10月中旬。平均湿度69％。年平均日照2389小时，年平均蒸发量1232毫米。最大风力11级，风向多为西北风。每年9月下旬开始结冻，最大冻土层深72厘米，5月中旬才能完全解冻。东部半农半牧区，气候较温和，4～7月基本为无霜期，夏季最高气温 30℃，冬季最低气温-10℃，平均日照12小时，年降雨量500至600毫米，多集中降于夏末秋初，春末夏初则多干旱。常见自然灾害有冰雹、干旱、霜冻、寒潮连阴雪、洪涝等。